Les comparto este excelente enlace que me he encontrado, donde se han dado a la tarea de enlazar a los mejores scripts mootools que se han creado, es un directorio bastante amplio para todos los que gusten de esta excelente libreria javascript.
El directorio de scripts mootools esta dividido en varias categorías donde encontraras galerias mootools, [...]

Mootools estrena versión Mootools 1.2.1 con muchas mejores y bugs arreglados, el soporte para Safari 2 en el Class.js ha regresado, que esperas descarga este excelente Framework Javacript.

Descargar Mootools 1.2.1
Que hay de nuevo en mootools

MenuMatic es un excelente script javascript hecho con MooTools 1.2 que no facilita la tarea de crear menus de navegación rápidos en base a listas.
Con solo modificar unos parámetros podrías elegir entre un menu vertical o un menu horizontal, como funciona? así…
HTML:
<link rel=”stylesheet” href=”css/MenuMatic.css” type=”text/css” media=”all” />
…
<ul id=”nav”>
<li><a href=”#” >Link 1</a></li>
<li><a href=”#” >Link 2</a>
<ul>
<li><a href=”#” [...]

Excelente el post que ha publicado Noupe con un total de 40 técnicas para mejorar la estética y funcionalidades de nuestros formularios utilizando CSS y Javascript, todas estas técnicas están apoyadas en frameworks javascript como Mootools y jQuery que ya le han robado el trono al prototype.
Enlace:Form Elements: 40+ CSS/JS Styling and Functionality Techniques

Llenar un formulario puede ser lo mas aburrido y difícil durante tu experiencia en un sitio web, pero esto puede mejorar la usabilidad y experiencia de tu visitante por tu sitio debes considerarlo como el aspecto mas importante a tomar en cuenta.
En cats who code han recopilado 10 scripts de mootools para mejorar formularios, entre [...]

noobSlide es un script javascript basado en el framework MooTools que nos permite hacer un slide con diferentes elementos de nuestra pagina, puedes aplicarlo a imágenes obteniendo una elegante galería o a capas (DIV) para obtener una navegación dinámica y muy elegante.
Si quieres ver otras posibilidades que noobSlide y ajax nos da sigue los enaces.
Enlace:

Ejemplos [...]

En SixRevisions me encuentro con una lista de sripts javascripts y ajax de calendarios y datepickers, muy buenos y bastante funcionales.

El primero Calendar Class es una clase javascript que utiliza MooTools, se me hace el mejor en cuanto a usabilidad y sencillez.

Pero no es la única opción esta Datejs que tiene ciertas características de funcionalidad [...]

MooTools Mocha UI es una excelente clase que aprovechando la potencia de MooTools v1.2 nos brinda la posibilidad de generar ventanas flotantes con una buena cantidad de efectos, utilizando canvas para generar las curvas en las ventas y otros aspectos pero sin duda la propiedad a considerar es su peso ya que es una libreria [...]

(E)2 Photo Gallery es una galeria open source hecha con Mootools, entre sus caracteristicas estan:

Features

Smooth Image Transitions
Quick change between 4 designs
Thumbnail Viewer
Automatic Photo Detection
Image Uploader Included
Four Design Viewer Options
No Database Needed
Automatic Adjustment to Image Sizes

Reads in Photo Meta Data (IPTC Info)
Titles
Descriptions
[...]